В августе 2020 года, накануне возобновления полноценных богослужений после карантинных ограничений, связанных с пандемией коронавируса, в Свято-Алексиевском соборе Самарканда прошла тщательная подготовка к открытию.

Территорию и храм привели в порядок, на полу нанесли разметку для соблюдения социальной дистанции между прихожанами. Эти месяцы стали серьёзным испытанием для прихода, но общими трудами собор готовился вновь принять верующих в своих стенах.